На противагу космополітів ендеміки, або ендеми, мають обмежений ареал, тобто не виходять за межі природної області або провінції, які мають виразні фізико-географічні особливості. Деякі вчені вважають, що поняття "ендемік" вживають в тих видів і родів організмів, які поширені в межах одного материка або тільки в частині. Ендемізм особливо характерно для ізольованих територій. Прикладами таких територій є віддалені від материків острова або, навпаки, озера, віддалені від моря.
Для регіонів, ізольованих від решти материка горами, пустелями або водними об'єктами, а також характерний видовий ендемізм. Зокрема, унікальну ендемічною флори має Капській півострів на півдні Африки. Там з майже семи тисяч видів рослин близько 90% - ендеміки. В Україні високим ендемізм характеризуються Кримські гори. Там проростає понад 240 видів ендемічних рослин. Наприклад, сосна Станкевича (Pinus stankevichii) і сосна Палласово (P. pallasiana), ареали яких обмежуються відповідно Південним берегом Криму та Кримськими горами.
Яскраво вираженим ендемізмом характеризується озеро Байкал, де 600 видів рослин і вдвічі більше тварин 3/4 складають ендеміки. Видовий ендемізм характерний також для гірських вершин, приклади яких приводили вище. Залежно від віку виділяють пелеоендеміків і неоендеміків. Палеоендеміками є австралійська фауна, гінкго дволопатеве (Ginkgo biloba), риба латимерія (Latimeria chalumnae) - представник давно вимерлої родини кистеперих риб. Неоендеміками вважають, зокрема з рослин, багато видів полину (Artemisia) і астрагала (Astragalus), які, виникнувши в Середній Азії, поступово розширюють свій ареал. Серед неоендеміків Британських островів називають білка (Sciurus vulgaris leucourus), яка відрізняється від континентальної світлим забарвленням шерсті. Палеоендемізм - це ознака звуження ареалу виду, згасає, а нео-ендемізмом - ознака, що характеризує розширення ареалу молодого виду, який прогресує в сучасних умовах.
Палеоендеміки зазвичай "чужими" видами для сучасних природних умов. У минулі геологічні епохи вони були шірокопоши-реніми. Такі види отримали назву реліктових або реліктів. Якщо вид відділений від головного ареалу і утворює своєрідний острів, то в такому випадку мова йде про ексклав. Такі острови формуються за рахунок зменшення площі ареалу, обумовленого кліматичними або антропічних факторами. Релікти поділяють на кліматичні (пов'язують з материковими заледеніння), едафічні або геоморфологические, пов'язані зі зміною едафічних факторів, і формаційні, тобто такі, які відносяться до живих рослинних формацій.
Кліматичні релікти, зокрема в помірних широтах північної півкулі, - це перш за все ті види (пологи), які збереглися з попередніх періодів (палеогену і неогену) в сховищах (рефугіумах) долини Дністра, Південного Поділля, південних відрогів Уралу, півдня Далекого Сходу, Західній Закавказзя. На Поліссі, в долині Дніпра, Дністра, Дону кліматичних реліктом є, водна папороть - сальвінія плаваюча (Salvinia natans), яка збереглася з теплого періоду. Реліктова флора і фауна в основному збереглася на окремих ділянках (теплих або холодних) гірських систем, які сприяли їх збереженню.
Зміна льодовикових періодів і міжльодовикові потепління призвели міграцію флори і фауни відповідно на південь і в зворотному напрямку. У той же час частина видів, коли відступав льодовик залишалася на території, заселених під час покривних зледенінь, і тепер вони є значно південніше їх головного ареалу. Такі анклави називають льодовиковими реліктами. Для Полісся такими реліктами є бруд (Ledum palustris), лохини (Vaccinium uliginosum) та інші болотні види. Представники післяльодовикового безлюдно-степовий посушливого періоду трапляються на північ від їх головного ареалу. Такі, зокрема, анклави вишні степової (Cerasus fruticosa), мигдалю степового (Amygdalis nana), деяких видів ковили (Stipa). Всі ці види (пологи) приурочені до сухих теплим схилів з легкими грунтами.
Едафічні релікти є свідками змін, наприклад, піщаних грунтів (суглинних і глинистих) в результаті ерозійних або дефляційних процесів, або навпаки. Зміна берегової лінії озер висихають або морів відступ також викликає зміни ґрунтового покриву, і відповідний флористичний і фауністичний склад біоти.
Формаційні релікти є наслідком зміни однієї рослинної формації іншою, коли окремі види продовжують розвиватися в складі обох формацій. Зокрема, місцезростання анемони дубравной в складі хвойних лісів свідчить про те, що в попередні періоди тут були поширені широколисті ліси. Наявність окремих особин їли в дібровах навпаки свідчить про те, що широколисті ліси тут витіснили попередню формацію темнохвойних деревостанів. Вік формаційних реліктів вимірюється сотнями років, тоді як кліматичних - тисячоліттями. Виділення кліматичних, едафічних і формаційних реліктів досить умовним, оскільки всі вони взаємопов'язані. Адже зміна клімату обов'язково відбивається на трансформації грунтово-рослинного покриву і тваринного населення.
Реліктами серед тваринного населення вважають види і пологи, ареал яких зменшується, оскільки сучасні умови є не цілком сприятливі для їх розвитку, тобто не відповідають їх екологічним потребам. Зменшується і кількість популяцій таких видів. Вони можуть бути старі за віком (гаттерия) і порівняно молодими (біла куріпка в Альпах). Поняття "релікт" і "палеоендемік" мають спільні ознаки. Відмінність в тому, що релікт не завжди обмежений ареал, а може займати значну територію. Ареал палеоендеміка завжди обмежений.