1. Мікрофлора рослин
Мікроорганізми є постійними «супутниками» не тільки людини і тварин, а й вищих рослин. Вони зустрічаються як на поверхні, так і всередині надземних і підземних органів рослин (стебел і листя, насіння, плодів, коренів).
Епіфітна мікрофлора знаходиться на поверхні надземної частини рослини протягом усього його життя. Вона одноманітна і не залежить ні від виду рослин, ні від їх місця зростання. Для мікроорганізмів епіфітна мікрофлори рослина - основне місце проживання. Епіфітна мікрофлора зберігається на насінні і при їх проростанні переходить на поверхню рослин. Найчастіше зустрічаються Bacteriumherbicolaaureum і Pseudomonasfluorescens. рідше - Bacteriamesentericus, Bacteriavulgaris. гриби, Escherichiacoli. Дослідження показали, що, виділяючи антимікробні речовини, епіфітні бактерії тим самим діють згубно на збудників захворювань рослин. Поряд з цим висловлюються припущення, що збудники захворювань рослин - фітопатогенні бактерії відбулися в процесі еволюції від епіфітних бактерій.
Мікрофлора ризосфери. Зона грунту, що знаходиться в контакті з кореневою системою рослин, називається ризосферу. а мікроорганізми, що розвиваються в ній - ризосферні. Виділяють два типи ризосфери: ближню (різоплану) і віддалену.
Різоплан розташовується безпосередньо на поверхні коренів, віддалена ризосфера - в радіусі 50 см від них. Кількість мікроорганізмів в ризосфері в 100 разів більше, ніж в грунті, де рослини не ростуть. Скупчення мікробів навколо коренів пов'язане з виділенням останніми різних поживних речовин. Крім кореневих виділень, мікроорганізми ризосфери використовують для харчування відмерлі кореневі волоски епідермісу.
Основна маса прикореневій ризосфери представлена різними неспороутворюючими бактеріями. Якісний склад мікрофлори ризосфери залежить від виду рослин. Так, провідне місце в ризосфері хрестоцвітних займають флуоресцирующие бактерії, конюшини - азотобактер і т.д. Чисельність видів, що населяють ризосферу, знаходиться в залежності від віку та фізіологічного стану рослин.
Максимальна кількість мікроорганізмів спостерігається в період кущіння, цвітіння, плодоношення. Бактерії ризосфери сприятливо впливають на рослини:
стимулюють його розвиток за рахунок збільшення в ризосфері мінеральних елементів живлення (мінералізація органічних речовин, залишків рослин, трупів тварин), утворення вітамінів, ростових речовин;
покращують структуру ґрунту;
проявляють антагоністичну активність по відношенню до фітопатогенних мікроорганізмів.
Поряд з користю, принесеної рослинам епіфітних і ризосферні бактеріями, вони здатні викликати і захворювання. Наприклад, Pseudomonasfluorescens при проникненні через пошкоджені тканини може викликати загнивання рослини.
микориза збільшує поглинаючу поверхню коренів рослин за рахунок розгалуження гіф гриба, створюючи тим самим сприятливі умови для живлення рослин;
рослини в свою чергу виділяють ряд ростових речовин, що стимулюють розвиток гриба.