Якщо потрібно зробити будь-якої внутрішній ремонт гідроцикли, пов'язаний з ходовою частиною машини, то його можна буде довірити фахівцям з автосервісу, якщо поблизу немає спеціалізованої майстерні. Якщо вам потрібні будь-які деталі, щоб довести ремонт ходової частини гідроцикли до кінця, то ви зможете придбати їх в тих місцях, де продають самі аквабайки. Вартість деталей залежить від поширеності моделі. Чим рідше використовуються гідроцикли вашої моделі, тим дорожче буде запчастина для неї. Щоб заощадити, іноді можна придбати деталі, що були у вжитку.
Ремонт гідроцикли може бути і зовнішнім, наприклад, пошкоджений корпус потрібно виправити. Тут не завжди можна звернутися до автомеханіка. Вони хоч і ремонтують корпусу автомобілів, але не звикли працювати з машинами, які опускаються в воду, адже їх корпусу зроблені з інших матеріалів і за іншими технологіями. Ремонт корпусу гідроцикли краще довірити фахівцям вузького профілю, тим, хто працює саме з аквабайками.
До іншого типу ремонту, як зовнішнього, так і внутрішнього, можна віднести тюнінг. Тут можуть «навертаються» двигуни, посилюватися їх потужність, улучаться стійкість і маневреність гідроцикли. Також проводиться забарвлення корпусу в незвичайні кольори, установка додаткових дзеркал, фар або захисних стекол. Такі роботи також краще довірити фахівцям вузького профілю.
Гідроцикли Ямаха, як найпоширеніші, піддаються ремонту частіше, незважаючи на надійність продукції цього виробника. Однак ремонт гідроциклів Ямаха обходиться значно дешевше, ніж всіх інших. Це також відбувається через поширеності марки. Деталі для гідроциклів Ямаха надходять на ринку часто, коштують не дорого, а фахівців, які можу зробити ремонт досить багато.
