Грунт - частина біосфери, де діють різні екологічні фактори; тому в природі існує безліч грунтових типів і їх різновидів з різним проявом біологічних процесів. Наприклад, південні грунту, сформовані в умовах оптимального поєднання екологічних факторів (достатня кількість тепла, вологи, харчування), відрізняються більш високою біологічною активністю. Північні грунту в умовах лімітує температурного чинника, промивного типу водного режиму, особливостей грунтоутворюючих порід і т.д. характеризуються низькою біологічною активністю і своєрідним ПБК. Іншими словами, різні екосистеми функціонують за участю різних ґрунтових організмів, що обумовлює рівень ґрунтової родючості і стійкість екосистеми до несприятливих факторів середовища.
Так, чорноземні грунти характеризуються високою врожайністю і високою стійкістю по відношенню до токсикантів. Грунти північного ряду - підзолисті і дерново-підзолисті - володіють менш вираженим родючістю, а також низькою стійкістю до антропогенного забруднення.
Залежно від типу грунту і її культурного стану відмінності виявляються в значних коливаннях чисельності та структури грунтової біоти взагалі і мікроорганізм зокрема. Найбільша кількість ґрунтових мікро- організмів міститься в чорноземах і окремих підтипів каштанових грунтів. Високою чисельністю мікроорганізмів характеризуються також сероземниє грунту (при зрошенні). На північ і південь регіону поширення цих грунтів чисельність мікробного населення скорочується. Мікробіота активно функціонує в основному у верхньому гумусового шарі, де зосереджений найбільший запас поживних елементів, тобто родючість грунтів і грунтова біота взаємопов'язані.
Структурні зміни у функціонуванні екосистем в різних грунтово-екологічних умовах визначаються участю різних груп ґрунтового біонаселенія в біохімічних процесах. Наприклад, в північних екосистемах в біологічному кругообігу активну участь бере грибне населення; на південь - в структурі мікробного ценозу переважають бактерії і актиноміцети.
Виявлено та видові особливості мікроорганізмів у функціонуванні різних екосистем (табл.). В екосистемах зі слабкою течією мінералізаціонних процесів (дерново-підзолисті і особливо підзолисті ґрунти) домінантами виступають види, які беруть участь в розпаді органічної речовини на ранніх етапах (Вас. Cereus, Вас. Virgulus, Вас. Agglomeratus). Більш глибока трансформація органічної речовини протікає за участю Вас. idosus, Вас. mesen- tericus, Вас. subtilis. В екосистемах з хорошим азотним режимом грунту присутні Вас. megatherium. Індикатором засолених грунтів є Вас. gasificans. В умовах надзвичайної посушливості екосистем (регіони сухостепной зони) в структурі бацилярних населення домінантою виступає Вас. mesentericus niger.
Таким чином, за структурою мікробного ценозу і особливо за видовим складом мікроорганізмів можна судити про перебіг грунтоутворювального процесу і стан екосистем.
Видовий склад бацил в грунтах різних типів,% (горизонту, або Aпах)