Воєнізоване угрупування, що відрізняється суворою дисципліною: її члени живуть фактично за статутом. Тільки представники "Боргу" не торгують унікальними породженнями Зони із зовнішнім світом: за чутками, всі знайдені цими людьми артефакти здаються вченим.
Кожен "Долговец" вважає своєю головною метою захист світу від впливу Зони. Більшість операцій угруповання пов'язані з винищенням монстрів, тому рейди "Боргу" нерідко позбавляють рядових сталкерів від багатьох нагальних проблем.
Давно і люто ворогує з угрупованням "Свобода".
Анархісти і шибайголови, які оголосили себе борцями за свободу на території Зони, і тому постійно конфліктують з армійськими підрозділами, військовими сталкерами і угрупованням "Борг".
"Свободівці" вважають, що інформацію про те, що відбувається в Зоні не можна приховувати від людства, таким чином заперечуючи монополію урядових організацій на володіння місцевими таємницями і чудесами.
Представники кримінального світу, які прийшли в Зону з різних причин: заробити на продажу артефактів, сховатися від закону, купити або продати зброю. При всьому цьому, основним промислом «справжніх пацанів» є грабежі, мародерство і вбивства сталкерів з метою легкої наживи. У Зоні багато подібного об'єкта рівнем від шпани до серйозних кримінальників. Живуть за поняттями, внаслідок чого, угруповання має організовану ієрархічну структуру на чолі з «паханом».
Члени цієї «понятійної» секти нерідко йдуть у вільне плавання, збиваючись в невеликі групи іменовані «ренегатів».
Люди, здатні виконати будь-яке завдання за гроші. Знають Зону і її породження гірше рядового сталкера, і часто гинуть там, де зелений новачок помітив би небезпека.
Але що стосується війни з людьми - тут вони знають толк.
Угрупування "Чисте небо"
Дослідники проявів Зони, маловідомий клан, загублений десь в болотах. Достовірно ніхто не знає, яка їхня чисельність, чим вони займаються і які цілі переслідують. Але ті рідкісні сталкери, що приходили з боліт, розповідають про хлопців в камуфляжі небесно-синього кольору.
Нечисленна угруповання, що складається виключно з найбільш мерзенних особистостей Зони. Бандити, мародери, зрадники і рецидивісти - колишні члени інших угруповань, що змінили і зрадили свої погляди. Цей набрід не має організованої структури і лідера як такого. Збиваючись в невеликі групи, полюють за легкою здобиччю, займаючись вбивствами і грабежами, як правило, молодих і недосвідчених сталкерів.
Найчастіше зустрічаються уздовж периметра аномальної зони відчуження.
Ренегати - це самі аморальні сталкери, які настільки завинили перед своїм угрупованням, що їх вигнали і ні в якому разі не приймають назад. У них немає ніетікі, ні моралі, ні законів. Їх ненавидять все сталкери, навіть бандити, які теж не особливо педантичні в плані моралі, але навіть вони вважають, що Ренегати живуть "не за поняттями". Їх загнали в самий глиб Зони - на болота, але навіть і там не залишали спроб знищити, що врешті-решт обернулося успіхом.
Цю нечисленну групу дослідників, в особі одного вченого Сахарова, назвати угрупованням можна тільки умовно.
Вчені відносяться до Мобільної лабораторії, розташованій прямо в центрі висохлого озера Янтар. Вона виглядає як невеликий металевий бункер з маленькими тонованими вікнами. Здатна витримати майже всі відомі людині пошкодження будь-якого характеру. Може бути переведена в автономний режим на нескольо місяців, для чого забезпечена надійними системами життєзабезпечення. У Зону доставляється вантажним вертольотом.
Бійці з кланів "Борг" і "Нейтрали" взяли на себе обов'язки по захисту старого і його скромної оселі від нескінченних потоків зомбованих сталкерів, які потрапили під дію сильного псі-впливу на території прилеглого заводу.
Угруповання, швидше за нагадує релігійну секту. Її члени вірять, що в центрі Зони спочиває еволюційний кристал неземного походження - Моноліт. Більшість сталкерів зневажають адептів "Моноліту", вважаючи їх божевільними. З часу свого утворення група перешкоджає просуванню сталкерів до центру Зони, мотивуючи це недобрими намірами останніх щодо Моноліту. З чуток, у "монолитовцев" є велика база десь ближче до центру Зони, але точного її розташування не знає ніхто, крім самих членів угруповання.