Підзона середньої тайги, хвиляста рівнина, клімат континентальний. Річка Унья має полугорний характер, плеса чергуються з перекатами. У долині поширені карбонатні породи, утворюються карстові печери, оголення. Панують ялинові і ялицеві ліси з домішкою кедра. У верхній течії повсюдно домінують ялинові і ялицеві ліси, в середньому і нижньому - темнохвойні формації зміщуються на вододільні простору, а екотопи по схилах річки займають дрібнолисті спільноти вторинного походження. Долина річки в середньому і верхній течії типова для річок передгірній смуги. Вона глибока, вузька з крутими, часто обривистими берегами. Флору вищих судинних спорових, голонасінних і покритонасінних рослин складають 410 видів: 376 - покритонасінні, 28 - спорові, 6 - голонасінні. Рівень видового багатства флори може бути оцінений як відносно високий, незважаючи те, що дана територія є типово лісовий. Це пов'язано зі значною різноманітністю місць проживання в верхів'ях р. Унья, де поширені гірські тундри і тундроподобние спільноти, а також з наявністю на берегах річки скельних оголень. Лишайники заказника представлені 185 видами. Шість з них в Республіці Комі виявлені вперше. В даний час ми маємо у своєму розпорядженні далеко не повними даними про різноманітність лишайників розглянутій території. Однак уже зараз можна стверджувати, що біота лишайників заказника «Уньінскій» характеризується високим видовим багатством, великою часткою рідкісних і охоронюваних лишайників. На території заказника було виявлено 120 видів афіллофороідних макроміцетов, серед них присутні індикатори пралісів. Загальний вигляд фауни заказника тайговий з переважанням в фауністичних комплексах сибірських, європейських і розповсюджених в Палеарктиці видів. Лише в гірських районах представлені елементи гірської фауни. У період польових досліджень відзначено проживання видів наземних хребетних тварин: чотири види земноводних, один вид плазунів, 120 - птахів і 46 - ссавців. Мисливсько-промислове значення мають 15 видів птахів і 20 видів ссавців. Видове різноманіття і чисельність великих представників мисливсько-промисловий фауни (лось, ведмідь, дикий північний олень, бобер та ін.) Відносно висока лише у верхній частині басейну р. Унья. Іхтіофауна річки включає 12 видів риб, в їх числі: сьомга, харіус, сиг, щука, язь, плотва, гольян, йорж, окунь, минь, голець вусатий, подкаменщик звичайний. В ході проведених польових робіт на території заказника було виявлено 52 види жуків, 65 видів клопів, 7 видів двокрилих.