Найдавніша історія Зауралля починається з кінця стародавнього кам'яного віку - палеоліту.
Найдавніша стоянка в Курганської області знаходиться у колишнього села Шікаевка Варгашінского району. На глибині близько 2 метрів знайдені кістки мамонта, вовка, зайця, птахів, а також кам'яні знаряддя із зеленої і червоної яшми. Вік стоянки - понад 11 тисяч років. На подібних стоянках великі колективи первісних мисливців жили століттями, при застосуванні методів загородного полювання. У Західному Сибіру відомі тільки три стоянки верхнього палеоліту, одна з яких знаходиться в Зауралля.
Неолітичних поселень (періоду нового кам'яного віку, VI-IV тис. До н.е.) в Зауралля відомо набагато більше, ніж стоянок попередніх епох. Це поселення у сіл Кошкіна та Охотіна в Білозерському районі, біля села Ташкова Шадринського району, біля села Білий Яр недалеко від м Кургану. Житла того часу нагадували напівземлянки і землянки, населення займалося в основному полюванням і рибальством.
Цікавий поки що єдиний в своєму роді пам'ятник в нашій країні - святилище Савін-1, яке знаходиться в Білозерському районі. Святилище розташоване на заплавній височини з хорошим оглядом місцевості, з усіх боків оточеній старицями річки Тобол. Воно являло собою два кільця, споруджених з рову. В рові і поруч з ним були ями, заповнені кістками тварин, по периметру кола стояли стовпи. У північній частині розташовувалися багаття, в південно-східній - поховання.
Подібні пам'ятники відомі в Західній Європі, де вони називаються «хенджи» або «Ронделі». Найвідоміший з них - Стоунхендж, розташований недалеко від Лондона. Святилища були одночасно і древніми астрономічними обсерваторіями для визначення часу, і місцями для проведення релігійних обрядів. Подібність святилищ-обсерваторій на великих територіях від Зауралля до Англії свідчить, що на цій території проживала одна спільність людей - індоєвропейська.
Епоха бронзи в Зауралля охоплює період XVII - VIII століть до н.е. В даний час на території нашого краю відомо кілька сот пам'ятників бронзового століття. У II тисячолітті до н.е. тут мешкали племена, які прийнято називати алакульской - на першу розкопаному могильнику біля озера Алакуль в Щучанского районі. Пізніше було знайдено кілька поселень біля сіл Комишне і Раскатіха в Прітобольном районі, села Язєв Куртамишского району, села Суботіне Сафакулевского району та ін. Населення займалося в основному скотарством і землеробством. Житла алакульцев розташовувалися по колу, в центрі якого була площа. Такі селища були тісно пов'язані один з одним, зароджувалася протогородского цивілізація. За своїми розмірами зауральські селища-протоміста не поступалися відомим стародавніх міст Сходу і Європи.
В середині I тисячоліття до н.е. місцеві племена познайомилися з залізом. Поліпшилася обробка землі, прискорився розвиток ремесла, особливо ковальського і збройового. У цю епоху лісостепове Зауралля населяли осілі і напівосілі племена племена скотарів-хліборобів. Про появу племінної знаті свідчать поховання того часу - кургани. Їх в нашому краї більше тисячі, проте великих - висотою від 5 до 10 метрів розкопано не дуже багато. Один з них - Царьов курган, який дав назву нинішньому обласному центру. Російськими першопрохідцями поруч з ним було засновано поселення Царьов Городище, яке пізніше стало називатися Курганської слободою, а потім містом Курганом.
Царьов курган мав висоту 5,5 м, діаметр - 100 м. Під курганної насипом була могильна яма глибиною 3 м, над нею - споруда з колод у вигляді шатра. Стінки поховання укріплені колодами і облицьовані плахами, в кутах знаходилися нари і полки для похоронного інвентарю: посуду, зброї, їжі і т.д. У центрі - поглиблення для установки саркофага. До поховання в могилі горів вогонь для очищення місця вічного існування вождя.
Етнічну приналежність племен, що проживали в той час в Зауралля, вчені пов'язують з фінно-угорських населенням, предками мансі, Ханти, угорців і восточноіранскімі населенням, яке очолювало на території нашого краю. В результаті переміщення племен в I-II століттях н.е. сталася тюркізація лісостепового Притоболья, почалося заселення Зауралля тюрками.
У XIII столітті територія нашого краю увійшла в сферу впливу Золотої Орди, а пізніше - до складу Сибірського ханства.
Російські люди вперше познайомилися з зауральські краєм в XV столітті. В процесі російської колонізації Зауралля спочатку переважала приватна ініціатива новгородських, згодом московських торгових людей, промисловців, які купували хутро в обмін на російські товари. На цих шляхах поступово створювалися промислові поселення - слобідки, зимарки, городки. Йшли на схід і християнські місіонери.
Рух російських людей за Кам'яний пояс до XVI століття йшло дуже повільно, і тільки після падіння Казанського й Астраханського ханств воно прискорилося. У 1574 році Іван Грозний видав купцям Строгановим жалувану грамоту на володіння зауральські землями по річці Тобол. Однак на шляху землепрохідців стояла перепона - Сибірське ханство під на чолі з ханом Кучум. У розгромі ханства видну роль зіграв похід Єрмака в Сибір, який спорядили Строганова. Похід почався восени 1581 року і тривав протягом року. Під керівництвом Єрмака було взято столицю ханства, повний же розгром завершили інші загони в 1586 році. З цього часу Зауралля увійшло до складу Російської держави.
Сибірський похід Єрмака
До приходу росіян тут проживали чотири основних етносу - татари, башкири, калмики і киргиз-кайсакі (предки казахів).